レベル1、レベル2、レベル3などとレベルが分かれている場合、すべての認定を取得するべきですか？

はい、ひとつの認定だけでもその分野のスキルを証明することができますが、両方取得することで幅広いスキルの証明をすることができ、キャリアアップや就職・転職に有利となります。
まずはレベル1の取得を目指すことをお勧めします。